• صفحه اصلی
  • مرور
    • شماره جاری
    • بر اساس شماره‌های نشریه
    • بر اساس نویسندگان
    • بر اساس موضوعات
    • نمایه نویسندگان
    • نمایه کلیدواژه ها
  • اطلاعات نشریه
    • درباره نشریه
    • اهداف و چشم انداز
    • اعضای هیات تحریریه
    • اصول اخلاقی انتشار مقاله
    • بانک ها و نمایه نامه ها
    • پیوندهای مفید
    • پرسش‌های متداول
    • فرایند پذیرش مقالات
    • اخبار و اعلانات
  • راهنمای نویسندگان
  • ارسال مقاله
  • داوران
  • تماس با ما
 
  • ورود به سامانه ▼
    • ورود به سامانه
    • ثبت نام در سامانه
  • English
صفحه اصلی فهرست مقالات مشخصات مقاله
  • ذخیره رکوردها
  • |
  • نسخه قابل چاپ
  • |
  • توصیه به دوستان
  • |
  • ارجاع به این مقاله ارجاع به مقاله
    RIS EndNote BibTeX APA MLA Harvard Vancouver
  • |
  • اشتراک گذاری اشتراک گذاری
    CiteULike Mendeley Facebook Google LinkedIn Twitter
فصلنامه علمی پژوهشی دنیای میکروب ها
arrow مقالات آماده انتشار
arrow شماره جاری
شماره‌های پیشین نشریه
دوره دوره 12 (1398)
دوره دوره 11 (1397)
دوره دوره 10 (1396)
دوره دوره 9 (1395)
دوره دوره 8 (1394)
دوره دوره 7 (1393)
دوره دوره 6 (1392)
دوره دوره 5 (1391)
دوره دوره 4 (1390)
دوره دوره 3 (1389)
شماره شماره 4 (پیاپی 9)
شماره شماره 3 (پیاپی 8)
شماره شماره 2 (پیاپی 7)
شماره شماره 1 (پیاپی 6)
دوره دوره 2 (1388)
دوره دوره 1 (1387)
پورفخرایی, الهه, بهمنش, مهرداد, عرفانی مقدم, مجید. (1389). جداسازی و کلون سازی ژن آنزیم کوتیناز باکتری ترموبیفیدا فوسکا. فصلنامه علمی پژوهشی دنیای میکروب ها, 3(شماره 3 (پیاپی 8)), 155-161.
الهه پورفخرایی; مهرداد بهمنش; مجید عرفانی مقدم. "جداسازی و کلون سازی ژن آنزیم کوتیناز باکتری ترموبیفیدا فوسکا". فصلنامه علمی پژوهشی دنیای میکروب ها, 3, شماره 3 (پیاپی 8), 1389, 155-161.
پورفخرایی, الهه, بهمنش, مهرداد, عرفانی مقدم, مجید. (1389). 'جداسازی و کلون سازی ژن آنزیم کوتیناز باکتری ترموبیفیدا فوسکا', فصلنامه علمی پژوهشی دنیای میکروب ها, 3(شماره 3 (پیاپی 8)), pp. 155-161.
پورفخرایی, الهه, بهمنش, مهرداد, عرفانی مقدم, مجید. جداسازی و کلون سازی ژن آنزیم کوتیناز باکتری ترموبیفیدا فوسکا. فصلنامه علمی پژوهشی دنیای میکروب ها, 1389; 3(شماره 3 (پیاپی 8)): 155-161.

جداسازی و کلون سازی ژن آنزیم کوتیناز باکتری ترموبیفیدا فوسکا

مقاله 1، دوره 3، شماره 3 (پیاپی 8)، پاییز 1389، صفحه 155-161  XML اصل مقاله (846.77 K)
نوع مقاله: مقاله پژوهشی
نویسندگان
الهه پورفخرایی1؛ مهرداد بهمنش2؛ مجید عرفانی مقدم* 1
1گروه بیوفیزیک، دانشگاه تربیت مدرس
2گروه ژنتیک، دانشگاه تربیت مدرس
تاریخ دریافت: 25 مهر 1392،  تاریخ بازنگری: 25 آبان 1392،  تاریخ پذیرش: 25 آبان 1392 
چکیده
سابقه و هدف: آنزیم کوتیناز متعلق به خانواده سرین هیدرولازها است و به دلیل خواص ساختاری و عملکردی در حذف آلودگی های زیست محیطی اهمیت بسیار زیادی دارد. هدف از این پژوهش، جداسازی و کلون سازی ژن آنزیم کوتیناز از باکتری ترموبیفیدا فوسکا (Thermobifida fusca) بود. مواد و روش‌ها: نمونه برداری از خاک های جنگلی شمال ایران صورت گرفت. با استفاده از محیط کشت اختصاصی و شرایط محیطی مناسب (10 pH= و دمای 60 درجه سانتیگراد) جداسازی باکتری بومی ترموفیل ترموبیفیدیا فوسکا انجام شد. پس از طراحی پرایمر ، ژن کوتیناز (cut1) از باکتری یاد شده جدا گردید. سپس در وکتور pBluescript sk کلون و به سویه DH5α اشریشیا کلی انتقال داده شد. به منظور تایید کلون سازی، هضم آنزیمی انجام ونمونه ها برای تعیین توالی ارسال گردید. یافته‌ها: در این تحقیق برای یافتن آنزیم کوتیناز با ویژگی‌های مطلوب تر‌، جداسازی و کلونینگ ژن آنزیم کوتیناز از باکتری ترموفیل بومی ترموبیفیدا فوسکا انجام شد. کلون سازی به کمک روش هضم آنزیمی و تعیین توالی مورد تایید قرار گرفت. با توجه به نتایج BLAST بیشترین شباهت با 98% همانندی با آنزیم کوتیناز cut1 و 96% شباهت باآنزیم کوتیناز cut-1.KW3 در باکتری ترموبیفیدا فوسکا مشاهده گردید. نتیجه گیری: با استفاده از آنزیم کوتیناز کلون شده در این تحقیق و با توجه به طیف وسیع عملکردی آن در برابر سوبستراهای متنوع و قابلیت تجزیه و سنتز انواع ترکیبات پلی استری، این آنزیم می‌تواند در رفع آلودگی‌های زیست محیطی نقش مهمی ایفا کند.
کلیدواژه‌ها
ترموبیفیدا فوسکا؛ کوتیناز؛ کلون سازی
موضوعات
باکتری شناسی؛ میکروب شناسی محیطی
مراجع
1. Carvalho CML, Aires-Barros MR, Cabral1 JMS. Cutinase structure, function and biocatalytic applications.  Electron J Biotechnol. 1998; 1(3): 160-173.

            2. Heredia A. Biophysical and biochemical characteristics of cutin, a plant barrier biopolymer. Biochim Biophys Acta. 2003; 1620(1-3): 1-7.

            3. Degani O, Salman H, Gepstein S, Dosoretz CG. Synthesis and characterization of a new cutinase substrate, 4-nitrophenyl (16-methyl sulfone ester) hexadecanoate. J Biotechnol. 2006; 121(3): 346-350.

            4. Xia Y, Yu K, Navarre D, Seebold K, Kachroo A, Kachroo P. The glabra1 mutation affects cuticle formation and plant responses to microbes. Plant Physiol. 2010; 154(2): 833-846.

            5. Liu Z, Gosser Y, Baker PJ, Ravee Y, Lu Z, Alemu G, Li H, Butterfoss GL, Kong XP, Gross R, Montclare JK. Structural and functional studies of Aspergillus oryzae cutinase: Enhanced thermostability and hydrolytic activity of synthetic ester and polyester degradation. J Am Chem Soc. 2009; 131(43): 15711-15716.

            6.  Billig S, Oeser T, Birkemeyer C, Zimmermann W, Hydrolysis of cyclic poly (ethyle                 terephthalate) trimers by a carboxylesterase from Thermobifida fusca KW3. Appl                         Microbiol Biotechnol. 2010; 87(5): 1753-1764.

            7. Chen S, Su L, Billig S, Zimmermann W, Chen J, Wu J. Biochemical characterization of the cutinases from Thermobifida fusca. J Mol Catal B Enzym. 2010; 63(3-4): 121-127.

    8. Gonçalves AP, Cabral JM, Aires-Barros MR. Immobilization of a recombinant cutinase by entrapment and by covalent binding. Kinetic and stability studies. Appl Biochem Biotechnol. 1996; 60(3): 217-28.

         9. Dworkin M, Falkow S, Rosenberg E, Schleifer KH, Stackebrandt E. The Prokaryotes. Third Edition. USA: Springer Science-Business Media, Inc. 2006.

     10. Zhang Z, Wang Y, Ruan J. Reclassification of Thermomonospora and Microtetraspora. Int J Syst Evol Microbiol. 1998; 48(2): 411-422

          11. Wei R, Oeser T, Zimmermann W. Cloning, expression and mutagenesis of cutinases isolated from Thermobifida fusca KW3 and their applications for polyethylene terephthalate hydrolysis. Submitted to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE. 2010.

آمار
تعداد مشاهده مقاله: 2,727
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,224
صفحه اصلی | واژه نامه اختصاصی | اخبار و اعلانات | اهداف و چشم انداز | نقشه سایت
ابتدای صفحه ابتدای صفحه

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

 

Journal Management System. Designed by sinaweb.